明清时期，晋商迅速成长崛起，经营规模日益扩大，足迹遍及大江南北。此时的晋商，许多经营地与所有者相隔千山万水，在信息不通，交通不便的情况下，很难对经营者进行直接约束。在此环境下，晋商为使事业能够更加壮大，在经营实践中创立了颇具现代特色的两权分离制度。晋商的两权分离，就是“财东”与“掌柜”的分离。财东是所有者，掌柜是经营者。财东在决定投资某行商业时，先物色一位有经验、可信赖的人作掌柜，并在有中间公证人参加的宴请席上，向掌柜授予全权，包括资金运用权、职工调动权、业务经营权，并签有契约合同，规定资本若干，由掌柜自主经营，财东不加干预。在今天看到的许多商号遗存的史料上，晋商普遍采取的是这种两权分离的治理结构。
产权清晰
财东作为出资者对企业（商号）资产拥有所有权，同时对经营成果拥有分配权。掌柜只是经营者，他有权在其经营内支配资产去赢利，但无权实施经营成果的分配。掌柜的能耐再大，也不能与财东换位。
权责明确
财东对于商号具体的经营过程采取超然态度，资本、人事全权委托掌柜负责，一切经营活动不加干预，日常的盈亏也不过问，让掌柜大胆放手经营。掌柜的权力非常大。掌柜在商号内部实行高度集权制，同仁位虽然有建议权，但大事则由掌柜裁夺。掌柜每年汇集营业报告表，造具清册，向财东汇报一次；第3年为一个账期，与财东决算一次。财东对掌柜的经营策略只有建议权，没有决策权。财东只能在决算分红时行使权利，平时也不得以商号名义在外活动，只有掌柜才能对外代表商号。
比较当前的许多企业，表面上已经建立起了现代企业制度，实现了所有权与经营权的分离，但这种分离并不彻底。比如当前的许多国有企业，作为出资者的政府这个大财东，没有晋商财东的那种开明，往往不愿意放权给经营者，过度干预经营；或者是经营者由政府委派，使所有者与经营者表面上分离，实质上的合一。国有企业效益的普遍低下，与此不无关系。
稳健理财
市场中不确定的因素很多，任何商家在经营中都难免会遇到诸如市场风险、信用风险等问题，并因此招致损失。为防范风险，晋商设计了一套较完善的制度。
建立资本风险基金
资本风险基金的建立，目的是为了防范因经营亏损而导致的资本亏折，以防出现“空底”，即现在的所谓“空壳企业”。晋商叫“预提护本”（也叫“预提倒款”）。“预提护本”，就是在账期分红时，从利润中按一定的比例预提，建立风险基金，预防未来可能发生的倒账损失。这项基金专款存储，一旦发生损失，以此作为补偿。这种预提款项叫“护本”。
建立企业发展基金
企业的发展，经营规模的不断扩大，需要不断扩充经营资本。晋商为了使企业的发展有足够的经营资金保证，创造了“倍股”、“公座厚利”等制度。所谓加周转使用，充作扩大经营的资金来源。“公座厚利”的制度，就是在职工股和财东银股未分配之前就提取一部分利润，作为“公座”，它与倍股不同，倍股是从股东分红中提取的，公座是从职工股和财东银股应享有的利润中撮的。不讼是倍股或公座厚利，其目的在于增加商号的流动资金，以扩大业务，反对急功近利和短期行为。
账面资产的稳健计价
晋商叫做“厚成”。所谓“厚成”，就是在年终结帐时，将应收账款、现存商品以及其它资产予以一定折扣，使企业的实际资产超过账面资产。
晋商的这一系列制度，充分体现了风险第一、收益第二的稳健理财思想。在现代企业中，经营的稳健已越来越被人们所重视。晋商的这些制度与现代企业的一些制度有很多相通之处，有些还正成为我们改革的重点。
诚信理财
晋商受孔孟道影响，崇尚信义，以诚信取胜。他们把儒家的传统做人准则融入经营理财中，树立起良好的社会信誉。他们经商虽以赢利为目的，但取利均以道德信义为根据，各商号在号规中大都规定了“重信义，除虚伪”，“贵忠诚，鄙利已，奉博爱，薄族恨”，以致各地百姓购买晋商商品，只认商标，不还价格。祁县乔家在包头的复盛油房，运胡麻油回山西销售，经手职工为图厚利，在油中掺假，掌柜发现后，立即命令另行换装，经济虽受了损失，却招得近悦远来，博得市民信赖，生意由此更加红火。
晋商在同业往来中既保持平等竞争，也坚守信义。在晋商中，相互称友好的同行为“相与”，凡是“相与”，必须善始善终，同舟共济。建立“相与”关系，需经过了解，认为可以共事，才与之银钱来往，否则婉言谢绝。即是“相与”，必须竭力维持，即使无利可图，也不中途绝交。
晋商的诚信理财思想，对现代企业的经营颇有启示。晋商为了信义，宁愿牺牲自己的利益，而我们现在的一些企业为了一已之利，不顾信义，坑害他人，使当前商业环境的信用水平陷入了低谷。要提高我们的商业信用水平，一要靠社会制度的约束，二要靠商业自救，培养提高人们的商业道德素质，象晋商那样，树立起诚信义利的理财思想，做到诚实不欺，以义制利，先义后利。
激励理财
晋商虽然创立了两权分离制度，给了经营者高度的自主经营权，但如果没有相应的激励机制，制度作用的发挥将会大打折扣。晋商在这方面创立了最有特色、也最具创造性的人力股制度，也称“身股”、“人身股”。这种制度重视了人力资本，使人力资本的价值得到了实现，不但使经营者获得极大的利益激励，也为他的财东带来了巨大的经济效益。
晋商的人力股制度包括以下几方面内容：一是人力股的计量。企业的主要职工（并非全部职工）每人可以顶一定的股份，股份的多少由财东根据职工任职时间、品质、能力和绩效来决定，从零点几厘到一股不等（一股分为十厘，一股面值一般为一万两白银）。一般是大掌柜（总经理）顶一股或九厘，二掌柜（副总经营）顶八厘、七厘，账房主管顶五厘、四厘，学徒工不可以顶股。这种计量已经注意到了劳动者的劳动数量和劳动质量。二是人力股的分红。在一个账期（一般为3年）结束时，人力股与财东的资本股一起参加分红。分红时，首先把公积金的积累放在首位，然后才是分红。每到账期，都要评定职员的功过，检查三年的成绩和问题，整顿人事，调整“人身股”厘数，并记入股本账。三是人力股的退出。一般资本股可以转让，人力资本股不能转让，顶股职工辞退或解雇后，当即终止其股份。人力股因为代表的是活动资本，只能在有劳动时享受，因此职工死亡后，子女不能继承，但可以继续享受一至二个账期的分红，退休职工作为情感性的照顾可以照常分红。
晋商的人力股制度，把职工的知力、能力与劳动所得紧密挂钩，使每个职工都意识到并重视自身价值的存在和实现，充分调动职工的劳动积极性，提高了企业经营效益，在知识经济时代到来的今天，人们越来越意识到知识的价值对企业经营的重要，也开始重视人力资本的管理，知识经济时代的竞争就是人才的竞争。我国的许多外资企业的部分民营企业已经开始建立人力资本制度或者进行了尝试，但大多数企业包括许多上市公司都还没有在这方面作出改革努力，这样的企业难以吸引人才，也就难以有竞争力。
晋商的开明、稳健、诚信和重视人力资本的理财思想，为现代企业经营管理者提供了一笔宝贵的经验财富，对研究、探讨今天的企业经营管理具有很高的价值。我们应该在总结、学习、借鉴前人的经验基础上，结合现代社会的现实环境，进行制度创新，使企业得到真正的发展
